005年，人事部、建设部、水利部联合印发了注册土木工程师(水利水电工程)执业资格制度暂行规定及其考试实施办法、考核认定办法。注册土木工程师(水利水电工程)资格考试实行全国统一考试，每年举行一次。凡拥有中国国籍、从事水利水电工程勘察设计及相关业务的专业技术人员，符合相关条件的，均可申请参加考试，考试合格者获得《中华人民共和国注册土木工程师(水利水电工程)资格证书》。取得资格证书的人员，经建设部、水利部注册审批后，可以注册土木工程师(水利水电工程)的名义执业。每一注册的有效期为3年，届满后需申请延续注册。
注册土木工程师(水利水电工程)执业资格制度实施后，水利水电工程勘察设计文件必须由注册土木工程师(水利水电工程)签字并加盖执业印章后方可生效。
为了推动水利水电勘察设计行业注册工程师制度的实施，自2000年9月起，水利部水利水电规划设计总院与中国水利水电勘测设计协会就开始着手相关工作。2002年7月，水利部批准成立水利水电勘察设计执业资格工作领导小组，并将办事机构设在水利部水利水电规划设计总院，筹备工作正式启动。2003年，全国勘察设计注册工程师管理委员会批准由水利部水利水电规划设计总院会同国家电力公司水电水利规划设计总院共同成立全国勘察设计注册土木工程师(水利水电工程)专业筹备管理委员会。11月，依托中国水利水电勘测设计协会成立了全国勘察设计注册工程师水利水电工程专业管理委员会和注册土木工程师(水利水电工程)执业资格考试专家组。目前，专业管理委员已审查通过了《注册土木工程师(水利水电工程)执业资格考试专业考试大纲》，考试专家组基本完成了两套考试试题的命题和考试复习手册的编写工作。
据悉，管委会正在加紧进行考核认定测试试题、考试试题、考核认定人员测试手册、考试复习手册的编制和考试题库的建立工作。计划于2005年全面开展考核认定，力争2006年开展首次考试。
2007年度首次全国注册土木工程师(水利水电工程)执业资格考试定于9月22日、23日举行。
2008年2月21日，人事部办公厅、中华人民共和国建设部办公厅、中华人民共和国水利部办公厅公布了勘察设计注册土木工程师(水利水电工程)资格考核认定结果，全国共4041人获得资格。
然而，由于国家职业资格目录调整，自2015年起停考一年。截止2016年12月31日，取得注册土木工程师(水利水电工程)人数已达到9293人，各个专业人数不确定。当年岩土实行启动注册时大概就这个数甚至不到。
关于水利部何时启动注册的问题，通过在水利部网站公众咨询中找到了一些回复：
- 2015年回复：暂无确定时间。
- 2018年2月回复：暂无确定时间。
- 2018年12月份回复：暂无确定时间。
- 2019年1月回复：暂无确定时间。
从目前最新的情况来看，水利部已将注册权移交给住建部，但住建部尚未作出回应。如果一名水利人是1978年(恢复高考的第一届大学生)考入大学，1982年毕业后一直从事水利设计工作，并拥有土木工程师(水利水电工程)证书，那么现在大约有60岁左右。根据2017年人社部表示延迟退休方案出台，老水利这辈人在退休前可能还无法看到这个真正实现注册执业的目标。
国家将注册土木工程师(水利水电工程)资格明确列为国家职业资格准入类的36项之一。从2000年代开始立项，到2005年进行考核认定，再到2007年开始考试，至今已有十几年的历史。人生中有多少个十几年？这可能是我们国家最长的行政许可项目之一。在执业实施过程中，这个过程也成为一个不大不小的笑话。
